11 加强边防
这一现状让于谦忧心忡忡——倘若边衅骤起，入侵者将势如破竹，毫无所挡。于谦看到了国家的危机，他不能坐视不管，"巡抚"的职责本来就是"巡行天下，抚 军济民"，何况大同、太原两镇都在于谦的巡抚区域。他深知改变这一现状必将损害一些人的既得利益，但是国家利益至上的原则使得于谦无所畏惧。
正统元年（1436），于谦呈给朝廷一道很长的奏章，提出了富国强兵的十条策略，其中有四条涉及边务。一、北方蒙古族瓦刺部虎视眈眈，不断寻衅，战事在 所难免，要随时做好战争的准备，因此必须有充足的边饷作保障，但是于谦反对增加百姓的负担，他建议将各处犯赃官吏所贪之粮食，运赴大同、宣府、甘肃、宁 夏，接济边储。
二、当时，山西、山东、河南、直隶卫所官军每岁轮流两班赴京操备，以致守城乏人，屯田荒芜，于谦建议分作三班：一班赴 京、一班守城、一班屯田，这样就军得宽力，民省供费。三、要优待军士，当时的状况是部分军士原籍离卫所有数千里之遥，而边卫军官往往擅自克扣士兵的口粮和 衣料，导致士兵在赴役中多有冻馁病死，于谦请求量拨口粮接济两千里外赴役之军士。四、于谦调查得知，当时各边官旗各仓侵欺物货，虚出通关，致使仓无现粮， 军士缺食，于谦要求严惩那些侵欺盗卖者，将他们解京治罪，以使奸顽警惧，军粮丰羡。
正统三年（1438）六月，于谦又上了一道奏章， 向朝廷陈述北部边防问题的严重性和整顿的迫切性，同时提出了强兵方略。一、大同等处总兵、镇守官贪图省事，只要有人寇声息，不论边报远近，就将边民驱入城 堡，委弃田禾牲畜。建议凡边报在数百里外，不见人马者，居民勿动；见人马而未入境者，居民戒严；人马入境者，方许居民入堡。若无边报，而总兵等官惊扰百 姓，听巡按御史具奏治罪。如此可以真正保障边民的安宁。二、建议将偏头关、大同、宣府等处的山西、河南班军改作两班，每年一班，轮流派遣，九月初驻守边 境，三月初各回本处，以使边军得到休整。三、大同府是军马总萃之地，宜多储粮，以备缓急。四、北方边境冬日马草匮乏，而军官又侵克草豆，致使战马疲弱，难 以征战，建议将大同、宣府诸处马匹中之精健者留在军中骑操，而将那些老病弱小之马匹退回民间放牧。五、山西、河南诸卫所城垣楼橹濠池损坏淤塞较多，守边总 兵、镇守等大多坐视不管，请令守城军队和民夫协力修理。
山西行都司十三卫俱在大同，区域广阔，相隔甚远，巡按御史不能遍历，于谦奏请朝廷遣监察御史一员到大同巡按，严防军卫违法坏军。于谦巡抚中看到雁门关的城墙多处坍塌，就奏请增补官军，修理关隘，以备不测。
国家边境的安宁是压在于谦心头一块沉重的石头，无论何时，他都无法卸下。正统三年（1438）的除夕夜，于谦没有一丝过年的轻松感，在山西太原寒冷的官 署里，他又在写着关于巩固边防的奏疏。他调查得知山西行都司所属官军俸粮折色钞贯，可是往往延期，而且主管官吏侵欺抵换，非唯官军不得实惠，而且有碍边境 防守，于谦奏请量拨钞五十万贯给山西大同府，积贮支给。
当时，朝廷大臣中也有人看到了于谦治理军伍、镇守边境的才能，正统初，由于宣 府、大同一带城池军马多不齐备，刑部尚书魏源就曾经建议朝廷将于谦改任副都御史，镇守宣府、大同，参赞机务，整搠军马。但是朝廷认为于谦巡抚河南、山西， 尽心尽力，政绩卓著，无人可以替代，所以就驳回了魏源所奏。
尽管于谦付出了不懈的努力，但是，正统间的明朝边防之弊已经是积重难返，终于未能抵挡正统十四年（1449）蒙古骑兵南下的铁蹄。